「財團法人台南市台日文化友好交流基金會」前身為「台南縣台日友好交流協會」，於2009年5月3日由前臺南縣長蘇煥智成立。因應縣市合併，於2011年2月19日更名為「台南市台日友好交流協會」，由當時的臺南市長賴清德市長擔任協會理事長。協會於2014年1月16日申請法人登記，同年4月16日更名為「社團法人台南市台日友好交流協會」，並於2017年2月19日遷移至臺南州立農業試驗場宿舍群丙種官舍（原日治時期農林廳職員宿舍）。2019年12月11日進行組織改制，於隔年2月19日定名為「財團法人台南市台日文化友好交流基金會」，由李退之擔任董事長一職。
本會以協助政府與民間促進對日交流為宗旨，辦理及參與各項臺日友好活動上不遺餘力，在社會各界大力支持下，成立至今已於臺南市境內舉辦各種不同類型的活動，可謂為臺南市對日的最佳代言人。本會主協辦的活動不可勝數，以下簡短臚列：
於總爺藝文中心舉辦文化觀光產業活動（即「總爺和風文化祭」），迄今已屆第七年；推廣臺南與宮城縣之間的教育交流，至今已屆七年，促成千餘名宮城縣學生至臺南進行教育旅行；協助舉辦「嘉南大圳之父」八田與一墓前祭活動，接待前首相森喜朗訪台及至八田與一紀念園區植櫻，並推動「八田與一」編入日本文部科學省檢定濟中學教科書等事宜；與京都市保持緊密友好交流，並於2018年促成兩市議會簽訂友好交流協定，成為全世界第一個與京都市議會簽訂友好交流協定的市議會；邀請北白川宮能久親王後代竹田恒泰赴真理大學演講並擔任臺南觀光文化大使；安排沖繩名櫻大學及日語學校拜訪臺南市內學校與社區；安排臺南青農至日本仙台市、平戶市等地做物產推廣銷售，促進兩地業者之合作；協助辦理「日本日交流聯誼會」，獲得熱烈迴響及好評，使原先在臺南投資的日商由八十家增至百餘家；接待來自日本東京都、京都市、橫濱市、小松市、仙台市、平戶市、石川縣、青森縣等各地人士，並保持友好互動迄今。

長年累月的交流活動，協會會員均踴躍參與，不僅收穫各界的高度評價與肯定，對於臺灣民眾與日本之認識與交流，亦起到正面積極的促進作用。在日籍人士眼中，臺南已是相當親日的地區，觀光參訪以及經貿合作之意願提升之下，對臺日兩地皆帶來顯著的助益。
協會與日本的交流，在歷任的理事長、總幹事、協會會員與社會各界的一致努力下，已積累相當豐碩的成果，「前人種樹，後人乘涼」是本人現今最佳寫照。承接董事長一職，本人深感責任重大，期許未來在任內持續為協會與日方保持緊密與良好互動，並多方簽訂友好協定，成為日人來臺南以及臺南人去日本的最佳聯繫平臺。更期待透過協會的力量，深化臺南與日本的情誼，促進民眾對日往來便利性的同時，亦成為臺灣和國際接軌的橋樑。